Jun Märkl staat bekend om zijn bijzondere kennis van het Duitse repertoire, zowel symfonische werken als opera, en kreeg de voorbije jaren veel lof en respect voor zijn verfijnde en eigenzinnige interpretatie van Debussy, Ravel en Messiaen.
Als zoon van een Duitse concertmeester en Japanse concertpianiste werd Märkl al vroeg omringd door muziek. Eerst speelde hij piano en viool, om later over te stappen naar directie. ’Muziek was mijn uitlaatklep." Hij studeerde bij grote namen als Sergiu Celibidache, Gustav Meier, Leonard Bernstein en Seiji Ozawa.
In zijn vrije tijd houdt Märkl van wildkamperen, en hij volgde een opleiding tot ranger in Afrika: "Doordat ik me zo bewust ben van mijn dubbele afkomst, kan ik me makkelijk verplaatsen in andere culturen. Ik breng veel tijd door in hotelkamers, dus zodra ik de kans krijg, trek ik eropuit met mijn camper: zo ontdek ik andere landen en culturen."
Jun Märkl is regelmatig te gast bij Brussels Philharmonic.